Le laboratoire de bioinformatique développe et met en œuvre des méthodes informatiques pour analyser les données complexes générées par les technologies modernes de séquençage à haut débit. Il accompagne les équipes du CRA-W et leurs partenaires dans l'identification et la caractérisation génétique des organismes, l'étude de la biodiversité et l'analyse des communautés microbiennes. Ses activités reposent notamment sur l'exploitation de ressources de calcul performantes et le développement d'outils bioinformatiques adaptés aux besoins des différents projets de recherche.
Analyses :
- Identification et caractérisation génétique d'espèces et de souches.
- Assemblage, annotation et comparaison de génomes, notamment bactériens et fongiques.
- Étude de la composition et de la diversité des communautés microbiennes par métabarcoding et métagénomique.
- Recherche et caractérisation de gènes d'intérêt (résistance aux antimicrobiens, virulence, fonctions métaboliques, etc.).
- Analyses phylogénétiques, de diversité génétique et de génomique des populations.
Méthodes et techniques :
- Analyse de données issues du séquençage à haut débit à lectures courtes et longues (Illumina, Oxford Nanopore Technologies, etc.).
- Contrôle qualité, alignement de séquences, assemblage de novo et annotation génomique.
- Classification taxonomique et analyse fonctionnelle de données métagénomiques.
- Développement et automatisation de pipelines bioinformatiques.
- Analyses statistiques, visualisation de données et calcul intensif.
Responsable :
Benjamin Dubois
Image générée par IA
Informations pratiques
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Bâtiment Jean-Baptiste de La Quintinie
Chée de Charleroi, 234 5030 Gembloux Belgique Tel : +32 81 87 40 08 - Benjamin DUBOIS
