Lipomme-Bio 2.0

Objectifs

Sur les bases des acquis du projet Lipomme-Bio 1.0, l’objectif du projet est de travailler en multi-leviers afin de proposer des stratégies alternatives au cuivre pour contrôler la tavelure du pommier et les maladies de conservation de fruits. En effet, au niveau européen le cuivre a été récemment placé sur une liste des substances candidates à la substitution. Trois leviers complémentaires seront travaillés : (1) le levier variétal et le degré de tolérance aux maladies, tavelure en priorité. De telles variétés arrivent sur le marché et les premières observations chez les producteurs ont montré qu’avec des variétés comme ‘Ducasse’ très tolérantes à la tavelure, on peut réduire le nombre de traitements de l’ordre de minimum 30 à 50% ; (2) l’intégration de la recherche de biostimulants pour renforcer la plante, augmenter sa robustesse et/ou en stimuler des mécanismes de défense acquise. Ceux-ci seraient couplés, tant aux substances fongicides agréées en P-bio, autres que le cuivre (principalement à base de soufre), qu’aux substances de base déjà mises en évidences (bicarbonates de sodium) ; enfin (3) la poursuite des optimisations et expérimentations menées dans le cadre du projet Lipomme-Bio 1.0 sur l’emploi de lipopeptides comme fongicides. Les résultats déjà obtenus lors du premier projet sont très encourageants en tant que mode alternatif de protection des plantes. L’étude de l’association de ces trois leviers constitue une piste de solution pertinente dans la recherche d’alternatives au cuivre et permettra de proposer les meilleures combinaisons d’inclusion de nouveaux produits de biocontrôle, de biostimulants dans des schémas de traitements qui intègreront les données des logiciels d’avertissement et le degré de sensibilité variétal à la tavelure.

Actions

Les actions réalisées dans le cadre du projet s’inscrivent dans la continuité directe des réalisations du projet Lipomme-Bio 1.0.

Une première priorité est de développer un procédé industrialisable de production et purification de surfactine et fengycine compatible avec les contraintes de l'agriculture biologique (pas d'exploitation d'OGM dans l'ensemble du procédé). Cette tâche se reposera sur les résultats obtenus dans le cadre de Lipomme-Bio et, en particulier, la sélection de souches naturelles surproductrices de fengycines et de surfactines. Le procédé sera développé à l'échelle pilote dans des réacteurs de 200 L et 2000 L.

Une gamme de lipopeptides et de biostimulants sera testée pour évaluer leur efficacité contre la tavelure en conditions contrôlées en serre. Les meilleurs candidats seront ensuite testés sur des jeunes arbres greffés en conditions semi-contrôlées se rapprochant de conditions de champs. L’aspect variétal sera également pris en compte via trois niveaux de sensibilité à la tavelure (Faible, Moyenne, Elevée). Enfin les meilleures substances ou combinaisons seront expérimentées en conditions de champ dans un verger expérimental. Les éventuels effets sur d’autres maladies foliaires que la tavelure seront également évalués.

Afin de mesurer l’efficacité des produits testés sur les maladies dites de conservations, des échantillons de fruits traités seront récoltés, stockés et observés au cours de d’une période de conservations de plusieurs mois.

Les résultats ainsi obtenus de réfléchir à des stratégies d’intégration des lipopeptides et biostimulants dans les schémas de traitements, pour une application adaptée et une efficacité optimale.

Rôle du CRA-W

Dans le cadre de ce projet, le CRA-W interviendra sur les expérimentations sur pommiers en conditions contrôlées et en conditions de champ dans le but d’évaluer l’efficacité des différents produits de biocontrôle qui seront sélectionnés.

Ces essais se feront en collaboration avec les partenaires du projet.

Le CRA-W participera également à la diffusion des résultats du projet, d’une part via la presse écrite, tant professionnelle et éventuellement scientifique, d’autre part au travers l’organisation et de la participation à divers évènements (salons, foires, visites d’essais, …).

Résultats Obtenus

Le projet LipommeBio 2.0 avait pour objectif d’identifier et d’évaluer des alternatives au cuivre pour la protection du pommier en agriculture biologique. Les travaux ont porté à la fois sur la production de molécules naturelles d’intérêt, appelées lipopeptides, et sur leur évaluation en conditions contrôlées et au verger.

Production et optimisation des lipopeptides

Une première partie du projet a été consacrée à l’optimisation de la production de la fengycine, un lipopeptide produit par une souche de Bacillus subtilis sélectionnée lors du projet précédent. Les travaux ont montré que l’oxygénation du milieu de culture joue un rôle déterminant dans la production de cette molécule. En améliorant l’apport en oxygène, les chercheurs ont presque doublé la quantité de fengycine produite.

Une étape importante de montée en échelle a également été réalisée, avec un passage de la production en laboratoire vers un bioréacteur de 10 litres. Cette transition s’est révélée plus complexe que prévu : même si la croissance bactérienne était comparable à celle obtenue en laboratoire, la production de fengycine restait initialement plus faible. Plusieurs ajustements techniques, notamment concernant l’aération et la gestion de la mousse générée pendant la fermentation, ont permis d’améliorer les performances du procédé.

Enfin, un protocole d’extraction et de purification a été mis au point afin d’obtenir une poudre concentrée en fengycine destinée aux essais biologiques réalisés par le CRA-W.

Résultats en conditions contrôlées

Des essais sur plantules de pommier ont été réalisés afin de confirmer les résultats obtenus lors du projet précédent. Les différents lipopeptides ont été évalués contre la tavelure du pommier, principale maladie fongique rencontrée en arboriculture biologique.

Les résultats confirment l’intérêt de la mycosubtiline formulée (LipoMyco), qui a de nouveau montré une bonne efficacité pour réduire le développement de la maladie. D’autres molécules, telles que la fengycine, la caspofungine et la daptomycine, ont également présenté des résultats encourageants et mériteraient d’être étudiées plus en détail.

Les essais ont également montré que l’efficacité de certains lipopeptides pourrait être améliorée lorsque les traitements sont préparés avec une eau légèrement acidifiée (pH 6,5). À l’inverse, leur association avec le bicarbonate de potassium n’a pas permis d’obtenir d’effet supplémentaire notable par rapport au bicarbonate utilisé seul.

Une autre piste explorée concernait l’utilisation d’ions cuivre obtenus par électrolyse de l’eau. Bien qu’une légère diminution des symptômes ait été observée à partir de certaines concentrations, l’efficacité est restée insuffisante pour envisager une utilisation pratique dans les conditions testées.

Semis de pommiers

Résultats au verger

Deux essais au champ ont été conduits en 2025 et 2026 sur les variétés Jonagold, Decosta et Pinova.

Les résultats montrent que la mycosubtiline utilisée seule ne permet pas d’assurer un contrôle suffisant de la tavelure dans les conditions réelles du verger, en particulier lorsque la pression de maladie est élevée. Son efficacité est meilleure lorsqu’elle est intégrée dans des programmes de protection associant d’autres matières actives autorisées en agriculture biologique, comme le soufre ou le bicarbonate de potassium.

L’année 2025 a été marquée par une très faible pression de tavelure, ce qui a limité la possibilité de mettre en évidence des différences importantes entre les traitements. En revanche, les observations menées en 2026 ont confirmé que les schémas associant plusieurs leviers de protection obtenaient généralement les meilleurs résultats.

Les essais ont également mis en évidence un point d’attention important : des symptômes de phytotoxicité sont apparus de manière récurrente dans les modalités comprenant du LipoMyco. Ces observations suggèrent que le produit doit être utilisé avec prudence et plutôt en alternance avec d’autres solutions. Les résultats laissent également penser que ces effets pourraient être liés à la formulation utilisée plutôt qu’à la molécule elle-même.

Vue du feuillage de pommiers en fonction des modalités testées (témoin non traité, schéma Cuivre + Soufre, schéma mycosubtiline, schéma avertissements GAWI)

Autres maladies du pommier

Au-delà de la tavelure, les essais ont permis d’évaluer l’impact des traitements sur d’autres maladies affectant le feuillage, les fruits ou leur conservation après récolte.

Concernant l’oïdium, la mycosubtiline n’a pas montré d’effet marqué lorsqu’elle était utilisée seule. Les meilleurs résultats ont été obtenus avec les stratégies combinant plusieurs matières actives. Les observations suggèrent également que le retrait du cuivre peut favoriser le développement de certaines maladies comme Elsinoë pyri, ce qui souligne l’importance de maintenir une protection globale du verger.

Maladies de conservation

Des suivis ont été réalisés sur des fruits stockés plusieurs mois après récolte afin d’évaluer l’effet des traitements sur différentes maladies de conservation.

Les résultats sont contrastés. Dans plusieurs cas, les stratégies de référence utilisées par les producteurs ou les schémas comprenant du cuivre restent les plus performants. Toutefois, certains résultats indiquent que la mycosubtiline et certains programmes alternatifs pourraient contribuer à réduire l’incidence de certaines maladies de conservation. Ces observations restent toutefois insuffisantes pour dégager des recommandations définitives et mériteraient des investigations complémentaires.

Différents symptômes de maladies de conservations des fruits

Enseignements du projet

Les résultats obtenus montrent que les lipopeptides constituent une piste prometteuse pour réduire la dépendance au cuivre en production biologique de pommes. La mycosubtiline apparaît comme la molécule la plus aboutie à ce stade, mais son utilisation seule ne permet pas encore de remplacer complètement les stratégies actuelles de protection.

Le projet a également mis en évidence le potentiel d’autres lipopeptides, notamment la fengycine, ainsi que l’intérêt d’associer plusieurs leviers de protection : biocontrôle, biostimulants, substances de base et variétés plus tolérantes aux maladies.

Partenariat et Financement

Le projet Lipomme-Bio 2.0 est un projet financé par le Service Public de Wallonie (SPW). Le projet est coordonné par le CRA-W et les partenaires impliqués sont l’Université de Liège Gembloux Agro-Bio-Tech au travers de l’unité TERRA Teaching and Research Center et le Groupement des Arboriculteurs Wallons pratiquant la production Intégrée ou la production Biologique (GAWI).

Plus largement le projet Lipomme-Bio 2.0 collabore étroitement avec d’autres projets et notamment le portefeuille de projet BioControl 4.0 afin d’atteindre les objectifs globaux communs entre ces projets.