FUN2TRAP

Utilisation des liquides de collecte de pièges à insectes pour la surveillance de champignons de quarantaine dans les forêts belges.

Le projet FUN2TRAP vise à réaliser une analyse moléculaire des fluides de collecte des pièges à insectes en tant qu’outil complémentaire de surveillance des agents pathogènes fongiques (de quarantaine) dans les écosystèmes forestiers. Le projet est divisé en quatre work packages dans lesquels nous mènerons des activités complémentaires d’optimisation et de validation de la méthode, ainsi que de diffusion des résultats.

Dans un premier temps, nous examinerons l’influence de la composition du fluide de collecte, des conditions de stockage et de la méthode d’extraction de l’ADN sur la capacité à récupérer de l’ADN fongique de haute qualité à partir des pièges à insectes, tant en conditions de laboratoire que dans des échantillons réels de fluides de collecte « contaminés » par des insectes, des débris végétaux et de l’eau de pluie. Nous étudierons ensuite l’influence du type de piège à insectes sur le nombre et la composition des spores fongiques capturées, en conditions contrôlées et en milieu extérieur, et comparerons les captures obtenues dans les pièges à insectes à celles issues de pièges à spores fongiques actifs et passifs.

La méthode de surveillance optimisée et développée dans le cadre de ces activités sera évaluée lors d’une campagne de surveillance dans des forêts wallonnes, résineuses et feuillues. Enfin, des protocoles détaillés et des estimations des coûts seront établis afin de faciliter l’adoption de cette méthode par les organisations nationales de protection des végétaux. Les résultats du projet seront largement diffusés au moyen de conférences, de publications scientifiques et d’échanges avec les partenaires du projet.

Les questions spécifiques auxquelles ce projet entend répondre sont les suivantes :

Les conditions météorologiques (pluies simulées), la fréquence de prélèvement du fluide de collecte (à intervalles d’une à quatre semaines), les additifs ajoutés au fluide de collecte et le choix du kit d’extraction de l’ADN influencent-ils la capacité à récupérer de l’ADN fongique de haute qualité à partir du fluide de collecte ?
Les pièges à insectes couramment utilisés diffèrent-ils significativement en termes de nombre et de nature des spores fongiques capturées ?
La présence de particules issues des insectes et des végétaux affecte-t-elle la sensibilité et la spécificité de la méthode (effets de matrice) ?
La communauté locale de spores fongiques caractérisée à partir des pièges à insectes correspond-elle à celle caractérisée à partir de pièges à spores plus couramment utilisés et installés au même endroit ?